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醫(yī)學(xué)人工智能及應(yīng)用 學(xué)術(shù)研究 國家重點科研項目
案例分享|基于云服務(wù)的新冠疫情防控系統(tǒng)
2020-09-04 分享:


案例背景


新冠疫情爆發(fā)給全世界醫(yī)療衛(wèi)生系統(tǒng)帶來巨大壓力。利用疫情監(jiān)控系統(tǒng)追蹤密切接觸者和感染者,以支持臨床決策是一種有效的疫情防控方法。但是,傳統(tǒng)的防控系統(tǒng)受時間、空間和靈活性限制,同時來自這些系統(tǒng)的報告往往是區(qū)域性的,來自社區(qū)和市級層面的信息缺乏關(guān)于疾病的充分信息,這會導(dǎo)致疫情防控措施低效。

對于湖北新冠疫情防控形勢來說,病歷眾多和人群分群挑戰(zhàn)著傳統(tǒng)的人工報告和追蹤方法。為應(yīng)對這一重大挑戰(zhàn),神州醫(yī)療與洪湖市聯(lián)合防控指揮部開發(fā)了新冠疫情防控系統(tǒng)(HHS):HHS在72小時內(nèi)搭建完成,主要應(yīng)用于湖北洪湖市(距離武漢145km,常駐人口超過90萬)的疫情防控。

HHS整合了傳統(tǒng)來源數(shù)據(jù)(例如病例報告系統(tǒng)和診斷實驗室)以及非傳統(tǒng)來源數(shù)據(jù)(包括結(jié)構(gòu)化電子病歷和移動設(shè)備上的社交數(shù)據(jù)),實時數(shù)據(jù)采集和高效數(shù)據(jù)分析,提供了有關(guān)癥狀,心理狀況,接觸史,社會行為和物理環(huán)境的詳細信息。

案例內(nèi)容



01
 基于云服務(wù)的硬件方案



在疫情爆發(fā)期,由于交通管制、隔離措施,使得采購部署硬件設(shè)施并不現(xiàn)實;同時數(shù)據(jù)處理及數(shù)據(jù)分析團隊分散各地,疫情當(dāng)?shù)丶夹g(shù)支持不足;數(shù)據(jù)來源不同平臺、機構(gòu)甚至地域,難以實現(xiàn)數(shù)據(jù)匯集;需求快速迭代,硬件要隨時準備功能拓展和性能提升。基于云服務(wù)的硬件方案提供了有效的解決方案。


02
 數(shù)據(jù)采集



9家定點醫(yī)院每日結(jié)構(gòu)化的電子病歷數(shù)據(jù);微信上報系統(tǒng)收集的居民個人實時健康信息;來自第三方PCR實驗室,第三方抗體實驗室和公共衛(wèi)生信息系統(tǒng)的每日診斷報告(圖1)。

微信圖片_20201210102134.png

圖1. 數(shù)據(jù)流處理分析示意圖


利用九家醫(yī)院內(nèi)部現(xiàn)有的健康信息系統(tǒng),并利用微信平臺開發(fā)了一個小程序,用于癥狀報告和空間數(shù)據(jù)收集。


03
數(shù)據(jù)處理



對收集數(shù)據(jù)進行清洗整理,通過交叉驗證等方法剔除重復(fù)、錯誤的信息,然后將相關(guān)的信息進行標(biāo)準化。其中疾病診斷使用的是SNOMED-CT和ICD10、檢查檢驗使用LONIC、手術(shù)使用ICD9等,在清洗過程中,對于非結(jié)構(gòu)化的文本信息,通過自然語言(NLP)技術(shù)進行結(jié)構(gòu)化。數(shù)據(jù)清洗整理好后,存入通用的數(shù)據(jù)模型(CDM)。數(shù)據(jù)模型元素和COVID-19的推薦同義詞來自54位中國專家,包括臨床醫(yī)生,研究人員,公共衛(wèi)生專業(yè)人員和信息專家。


04
倫理審查,隱私保護和數(shù)據(jù)安全



南方醫(yī)院倫理委員會批準了此項研究。疫情防控系統(tǒng)內(nèi)所有用戶都同意共享使用此系統(tǒng)所需的信息。整個系統(tǒng)部署中,特別強調(diào)數(shù)據(jù)安全和隱私保護問題。

實施了標(biāo)準的安全設(shè)置和軟件(例如,防火墻,數(shù)據(jù)加密)。虛擬專用網(wǎng)絡(luò)用于遠程技術(shù)支持和數(shù)據(jù)分析。

為保護患者的隱私,對數(shù)據(jù)設(shè)置了不同的訪問級別。匯總報告是數(shù)據(jù)共享的主要形式。洪湖市新冠疫情防控指揮部的專家團隊擁有最高水平的數(shù)據(jù)訪問權(quán)限。他們使用數(shù)據(jù)對患者進行分類,協(xié)調(diào)社區(qū)中的社會工作者,并分配醫(yī)療資源。遠程分析團隊無法訪問患者的身份。項目之初,數(shù)據(jù)安全和隱私保護專家(均獲得HIPAA法案認證)設(shè)計和設(shè)置了此項數(shù)據(jù)訪問權(quán)限機制。

獨立審核員負責(zé)監(jiān)視任何違反規(guī)則的情況,并報告和更正規(guī)則?;仡櫺允占瘮?shù)據(jù),入組前先要獲取住院患者書面知情同意。

最重要的是,所有授權(quán)人員都接受了有關(guān)數(shù)據(jù)安全性和隱私保護的培訓(xùn),另外,還簽署了具有法律約束力的承諾函。此外,該團隊與云計算服務(wù)提供商緊密合作,將敏感數(shù)據(jù)與其余數(shù)據(jù)區(qū)分開。

應(yīng)用效果



01
基于手機社交媒體平臺,實施人群的綜合監(jiān)控。



從1月26日洪湖確診第一例到2020年3月16日,所有確診COVID-19的患者均已出院,總共383例COVID-19病例,不幸的是其中死亡13例。在巨大的壓力下,HHS于2月14日啟動,并在72小時內(nèi)成功部署。到3月16日,自行報告的累計數(shù)量達到1750萬,最大每日活動報告達到90萬人次。

基于手機社交媒體平臺,實施了針對不同人群的綜合監(jiān)控。其中包括一般人群,住院和出院患者,感染風(fēng)險較高的人(即:有去武漢的旅行經(jīng)歷、確診病例的接觸史或在隔離地點接受醫(yī)學(xué)觀察的人)以及衛(wèi)生保健專業(yè)人員(即醫(yī)生、護士、公共衛(wèi)生專家和社會工作者)。

參考文本框1有關(guān)居家隔離的普通人群的問卷調(diào)查的詳細信息。該問卷由南方醫(yī)院傳染病專家提出,經(jīng)討論會議修改,當(dāng)?shù)卣ぷ魅藛T,當(dāng)?shù)嘏R床醫(yī)生,公共衛(wèi)生專業(yè)人員和信息專家參加了討論會議。3月2日,政府評估開放洪湖的工作和生產(chǎn)限制時,有關(guān)求職支持的項目添加到調(diào)查表中。

Demographiccharacteristics

? Name

? ID number

? Gender

? Address (semi-structured)

? Phone number (free text)

Spatial information

? Current location (structured)

Epidemiological exposure

? Have you visited or stayed in communities with confirmed cases inthe last 14 days? (Yes/No)

? Have you been in contact with confirmed cases in the last 14 days? (Yes/No)

? Have you been in contact with residents from Wuhan City or fromthe community with case reports or who have had respiratory symptoms in thelast 14 days? (Yes/No)

? Have you participated in small-scale gatherings with more than 2cases reported in the last 14 days? (Yes/No)

Physical conditions

? Today's physical condition: good/cough/runny nose/chesttightness/diarrhea/muscle soreness? (multiple choices)

? Today's body temperature?

Psychological conditions

? Did you feel nervous, fearful or anxious today? (Yes/No)

Community support

? Are there public health officials to visit you for investigation?(Yes/No)

? Were there any social workers who called you or came to your hometo help solve the reported problems? (Yes/No)

Job-seeking support

? Are you willing to work locally? (free text)

? Are you willing to participate in free skill training? (free text)


文本框1:微信實時問卷

社區(qū)工作者通過電話或上門拜訪跟蹤了10,000多個陽性報告(例如,“我的體溫超過37.3°C”或“今天我咳嗽得很厲害”)。協(xié)助30多人到發(fā)燒門診進一步篩查,然后隔離。這是由城市居民通過新的信息渠道發(fā)起的一種主動監(jiān)視機制,并有效地進行了COVID-19篩查。高覆蓋率(超過95%的居民)和每日活躍報告(超過60萬人次)證明了在COVID-19流行期間進行密集監(jiān)測的可行性。

陽性報告病歷(日超50萬人次報告0.10%-0.12%的概率)提供了有力的證據(jù),表明防控措施已經(jīng)有效地阻止了疫情的擴散。


02
政策制定決策支持



監(jiān)測數(shù)據(jù)的波動和趨勢分析可支持與政策相關(guān)的決策。由于人口眾多,趨勢的穩(wěn)定性和波動性為地方當(dāng)局評估疾病管理的有效性并作出相應(yīng)的及時調(diào)整提供了有力的證據(jù)。空間分析也發(fā)揮了關(guān)鍵作用。由患者集中度表示的社區(qū)內(nèi)密切接觸者的聚集(圖2),說明了當(dāng)?shù)匾咔楸l(fā)的高風(fēng)險,這將自動觸發(fā)社區(qū)工作者的家訪工作。

微信圖片_20201210102233.png

圖2:洪湖衛(wèi)生報告熱圖




03
臨床決策支持和資源優(yōu)先級



基于住院患者死亡率預(yù)測系統(tǒng)建立的臨床決策支持系統(tǒng),用于改善COVID-19患者臨床護理,降低死亡風(fēng)險并優(yōu)先分配有限的醫(yī)療資源。

基于多葉浸潤,低淋巴細胞增多癥,細菌合并感染,吸煙史,高血壓史和年齡(MuLBSTA)評分系統(tǒng),實際上這是一個針對COVID-19住院患者死亡率預(yù)測系統(tǒng),383個病歷中有36個患者被劃分為高死亡風(fēng)險人群(MuLBSTA評分≥12),他們被收治在重癥監(jiān)護區(qū)域或更頻繁地進行重要生化標(biāo)記篩選。據(jù)作者所知,這是針對COVID-19患者的死亡風(fēng)險預(yù)測系統(tǒng)的首次實際應(yīng)用。


04
出院患者的隨訪



我們使用社交媒體平臺對出院患者進行登記注冊,并要求患者在出院后的兩個月內(nèi)每天報告其癥狀。隨訪系統(tǒng)啟動后,在3天內(nèi)達到了100%的覆蓋率。系統(tǒng)上報病歷如高燒等癥狀的復(fù)發(fā),社區(qū)工作者將通過家訪工作直至安排再次入院。


知識產(chǎn)權(quán)聲明:以上案例內(nèi)容由神州醫(yī)療科技股份有限公司提供,詳細內(nèi)容可查閱(J Med Internet Res 2020;22(4):e18948) doi: 10.2196/18948


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